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Warum wandert die DNA bei der Gelelektrophorese zum Pluspol?
Die Auftrennung erfolgt in einem Agarosegel und beruht auf der Wanderung der DNA in einem elektrischen Spannungsfeld. Die negativ geladenen Phosphatgruppen der DNA verursachen eine Wanderung von der Kathode zur Anode. DNA wandert umso schneller, je kleiner das Molekül ist.
Auf welche Weise lassen sich die Längen der DNA-Fragmente bestimmen?
Die Agarose-Gelelektrophorese ist eine Methode zur Auftrennung von DNA. Die DNA-Fragmente werden nach ihrer Größe in der Gelmatrix getrennt.
Was zeigt die Gelelektrophorese?
Gelelektrophorese ist eine analytische Methode der Chemie und Molekularbiologie, um verschiedene Arten von Molekülen zu trennen. Dabei wandert eine Mischung aus zu trennenden Molekülen unter Einfluss eines elektrischen Felds (siehe dazu: Elektrophorese) durch ein Gel, welches in einer ionischen Pufferlösung liegt.
Wie groß ist ein DNA Fragment?
In der zweiten und dritten Spur sind DNA-Proben aufgetrennt worden. Man kann erkennen, dass die erste Probe vier verschieden große Fragmente enthält, die etwa 4500, 2500, 1500 und 1300 Basenpaare lang sind. Die zweite Probe enthält ein Fragment von 8 und eines von 2,5 Kbp.
Wie lassen sich die Längen der Fragmente bestimmen?
Als Referenz lässt man einen Marker aus DNA-Molekülen mitlaufen, deren Länge man kennt. DNA/RNA Fragmente sind nativ nicht sichtbar und werden deshalb mit Ethidiumbromid oder Megafluor angefärbt. Die Färbung erzeugt die typischen sichtbaren „Banden“ im Trägermedium.
Wie lange dauert Gelelektrophorese?
Gießen des Agarosegels, Auftragen der fertig verdauten DNA-Proben auf das Agarosegel, Start der Elek- trophorese. Diese dauert ebenfalls ca. 1,5 Stunden.
Was ist ein DNA Fragment?
Eine Standard-DNA-Leiter enthält Fragmente zwischen etwa 100 Basenpaaren und 10.000 Basenpaaren. Spezielle DNA-Leitern können im Bereich besonders langer oder besonders kurzer DNA-Fragmente ihren Schwerpunkt haben und erleichtern damit eine genauere Größenbestimmung.